В игре рассказывается история многих персонажей. Вы узнаете о том, кем были члены Акацуки до входа в организацию. Мы узнаем больше о Шисуи Учиха. В этой игре доступно более 100 играбельных персонажей, из которых: воскрешенные каге, четверку звука, Обито (джинчурики десятихвостого), Механический Наруто; Орочимару во время пребывания в Акацуки и многие другие. В игре присутствует новая система соревнований — Турнир, где вы должны сражаться два на два и зарабатывать очки. Ко всему этому, теперь доступна возможность комбинировать свои дзюцу, а также использовать командные пробуждения с одним или двумя персонажами, которые находятся в поддержке (это возможно не со всеми персонажами). Кишимото лично принимал участие в дизайне игровых персонажей и редактировании игры.